Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms