Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms