Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS25P62851 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS25P62851 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS25P62851 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS25P62851 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS25P62851 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS25P62851 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS25P62851 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS25P62851 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS25P62851 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS25P62851 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS25P62851 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS25P62851 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS25P62851 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS25P62851 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS25P62851 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS25P62851 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS25P62851 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS25P62851 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS25P62851 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS25P62851 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS25P62851 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS25P62851 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS25P62851 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS25P62851 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS25P62851 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS25P62851 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS25P62851 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS25P62851 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS25P62851 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS25P62851 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS25P62851 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS25P62851 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS25P62851 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS25P62851 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS25P62851 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS25P62851 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS25P62851 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS25P62851 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS25P62851 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS25P62851 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS25P62851 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS25P62851 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS25P62851 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS25P62851 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS25P62851 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS25P62851 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS25P62851 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS25P62851 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS25P62851 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS25P62851 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS25P62851 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS25P62851 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS25P62851 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS25P62851 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS25P62851 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS25P62851 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS25P62851 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS25P62851 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS25P62851 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS25P62851 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS25P62851 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS25P62851 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS25P62851 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS25P62851 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS25P62851 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS25P62851 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS25P62851 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS25P62851 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS25P62851 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS25P62851 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS25P62851 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS25P62851 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS25P62851 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS25P62851 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS25P62851 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS25P62851 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS25P62851 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS25P62851 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS25P62851 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS25P62851 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS25P62851 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS25P62851 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS25P62851 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS25P62851 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS25P62851 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS25P62851 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS25P62851 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS25P62851 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS25P62851 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS25P62851 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS25P62851 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS25P62851 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS25P62851 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS25P62851 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS25P62851 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS25P62851 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS25P62851 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS25P62851 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS25P62851 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms