Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTP1P59025 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTP1P59025 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTP1P59025 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTP1P59025 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTP1P59025 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RTP1P59025 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RTP1P59025 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTP1P59025 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTP1P59025 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTP1P59025 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTP1P59025 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTP1P59025 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTP1P59025 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP1P59025 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP1P59025 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP1P59025 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP1P59025 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP1P59025 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP1P59025 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP1P59025 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP1P59025 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP1P59025 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP1P59025 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP1P59025 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTP1P59025 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP1P59025 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP1P59025 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP1P59025 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP1P59025 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP1P59025 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP1P59025 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP1P59025 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP1P59025 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP1P59025 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP1P59025 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP1P59025 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP1P59025 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTP1P59025 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP1P59025 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP1P59025 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP1P59025 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP1P59025 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP1P59025 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP1P59025 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP1P59025 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP1P59025 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP1P59025 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP1P59025 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP1P59025 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP1P59025 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP1P59025 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP1P59025 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP1P59025 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP1P59025 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP1P59025 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP1P59025 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP1P59025 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP1P59025 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP1P59025 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP1P59025 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP1P59025 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP1P59025 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP1P59025 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP1P59025 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP1P59025 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP1P59025 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTP1P59025 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTP1P59025 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTP1P59025 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTP1P59025 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RTP1P59025 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTP1P59025 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTP1P59025 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP1P59025 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP1P59025 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP1P59025 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP1P59025 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP1P59025 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP1P59025 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP1P59025 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP1P59025 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP1P59025 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP1P59025 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP1P59025 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP1P59025 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP1P59025 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP1P59025 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP1P59025 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms