Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP107P57740 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP107P57740 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP107P57740 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP107P57740 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP107P57740 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP107P57740 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP107P57740 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP107P57740 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP107P57740 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP107P57740 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP107P57740 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP107P57740 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP107P57740 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP107P57740 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP107P57740 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP107P57740 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP107P57740 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP107P57740 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP107P57740 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP107P57740 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP107P57740 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP107P57740 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP107P57740 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP107P57740 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP107P57740 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP107P57740 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP107P57740 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP107P57740 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP107P57740 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP107P57740 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP107P57740 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP107P57740 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP107P57740 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP107P57740 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP107P57740 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP107P57740 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP107P57740 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP107P57740 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP107P57740 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP107P57740 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP107P57740 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP107P57740 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP107P57740 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP107P57740 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP107P57740 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP107P57740 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP107P57740 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP107P57740 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUP107P57740 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUP107P57740 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUP107P57740 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUP107P57740 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP107P57740 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP107P57740 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP107P57740 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP107P57740 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP107P57740 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP107P57740 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP107P57740 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP107P57740 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP107P57740 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP107P57740 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP107P57740 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP107P57740 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP107P57740 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP107P57740 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP107P57740 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP107P57740 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP107P57740 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP107P57740 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP107P57740 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP107P57740 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP107P57740 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP107P57740 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP107P57740 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP107P57740 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP107P57740 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP107P57740 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP107P57740 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP107P57740 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP107P57740 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP107P57740 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP107P57740 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP107P57740 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP107P57740 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP107P57740 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP107P57740 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP107P57740 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP107P57740 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP107P57740 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP107P57740 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP107P57740 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP107P57740 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP107P57740 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP107P57740 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP107P57740 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP107P57740 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP107P57740 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP107P57740 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.6 ms