Protein–RNA interactions for Protein: P47100

TY1B-JR2, Transposon Ty1-JR2 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-JR2P47100 snR7-SsnR7-S 179 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-JR2P47100 YDR391CYDR391C 699 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-JR2P47100 ODC2YOR222W 924 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-JR2P47100 SEA4YBL104C 3117 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-JR2P47100 PXA1YPL147W 2613 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-JR2P47100 ARX1YDR101C 1782 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1B-JR2P47100 YDR230WYDR230W 348 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1B-JR2P47100 snR17bsnR17b 332 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1B-JR2P47100 RPA14YDR156W 414 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1B-JR2P47100 YGL185CYGL185C 1140 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1B-JR2P47100 HSP150YJL159W 1242 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1B-JR2P47100 GIP2YER054C 1647 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1B-JR2P47100 MPS3YJL019W 2049 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1B-JR2P47100 FOB1YDR110W 1701 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1B-JR2P47100 BRE4YDL231C 3378 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 YOR296WYOR296W 3870 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 KRE6YPR159W 2163 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 RPL24AYGL031C 468 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 TVP38YKR088C 1014 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 RPS19AYOL121C 435 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 EUG1YDR518W 1554 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 TKL1YPR074C 2043 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 FDC1YDR539W 1512 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 KTR2YKR061W 1278 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 LSG1YGL099W 1923 nt6□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 VPS30YPL120W 1674 nt6□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 SUI1YNL244C 327 nt6□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 IMA1YGR287C 1770 nt6□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 PCS60YBR222C 1632 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 SUA7YPR086W 1038 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 JEN1YKL217W 1851 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 YIR007WYIR007W 2295 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 LHP1YDL051W 828 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 RPL22AYLR061W 366 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 KIN3YAR018C 1308 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 RDL1YOR285W 420 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 UBA1YKL210W 3075 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 AXL2YIL140W 2472 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-JR2P47100 AAD3YCR107W 1092 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 BSC1YDL037C 987 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 THI13YDL244W 1023 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 THI11YJR156C 1023 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 LRG1YDL240W 3054 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 YPR174CYPR174C 666 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 HLJ1YMR161W 675 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 YBR225WYBR225W 2703 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 SSM4YIL030C 3960 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 MET4YNL103W 2019 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 GTT1YIR038C 705 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 BMT2YBR141C 1014 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 ASC1YMR116C 960 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 BBC1YJL020C 3474 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 HIS5YIL116W 1158 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 RAD14YMR201C 1116 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 HXT17YNR072W 1695 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 PFK1YGR240C 2964 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 SSU1YPL092W 1377 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 HEM15YOR176W 1182 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 BOP2YLR267W 1713 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 DAL4YIR028W 1908 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1B-JR2P47100 YKR104WYKR104W 921 nt5.9□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 YAR030CYAR030C 342 nt5.9□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 YER077CYER077C 2067 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 MMT1YMR177W 1533 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 VPS53YJL029C 2469 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 RPO31YOR116C 4383 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 ELO2YCR034W 1044 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 YIL077CYIL077C 963 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 GLO4YOR040W 858 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 PCL10YGL134W 1302 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 DUG1YFR044C 1446 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 CDC4YFL009W 2340 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 CLA4YNL298W 2529 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 ROD1YOR018W 2514 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 PUB1YNL016W 1362 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 MRH4YGL064C 1686 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 RIP1YEL024W 648 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 YGR017WYGR017W 894 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 YMR084WYMR084W 789 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 NUP2YLR335W 2163 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 FHL1YPR104C 2811 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 MAG1YER142C 891 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 YLR296WYLR296W 327 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 YPR022CYPR022C 3402 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 HSP104YLL026W 2727 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 MTC3YGL226W 372 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 YSF3YNL138W-A 258 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 ARG4YHR018C 1392 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 YEN1YER041W 2280 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1B-JR2P47100 YMR130WYMR130W 909 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1B-JR2P47100 PPG1YNR032W 1107 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1B-JR2P47100 OPY1YBR129C 987 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1B-JR2P47100 PMA1YGL008C 2757 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1B-JR2P47100 DAL81YIR023W 2913 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1B-JR2P47100 NMT1YLR195C 1368 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1B-JR2P47100 CLF1YLR117C 2064 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1B-JR2P47100 PIR3YKL163W 978 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1B-JR2P47100 RPL19BYBL027W 570 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1B-JR2P47100 BIK1YCL029C 1323 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1B-JR2P47100 MET3YJR010W 1536 nt5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.5 ms