Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHKA1P46020 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PHKA1P46020 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHKA1P46020 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHKA1P46020 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHKA1P46020 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHKA1P46020 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHKA1P46020 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHKA1P46020 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PHKA1P46020 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PHKA1P46020 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PHKA1P46020 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PHKA1P46020 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PHKA1P46020 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHKA1P46020 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHKA1P46020 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHKA1P46020 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PHKA1P46020 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PHKA1P46020 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PHKA1P46020 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHKA1P46020 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHKA1P46020 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PHKA1P46020 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHKA1P46020 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PHKA1P46020 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHKA1P46020 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PHKA1P46020 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHKA1P46020 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PHKA1P46020 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PHKA1P46020 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PHKA1P46020 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PHKA1P46020 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PHKA1P46020 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.54■■■□□ 2
PHKA1P46020 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHKA1P46020 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PHKA1P46020 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PHKA1P46020 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PHKA1P46020 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PHKA1P46020 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PHKA1P46020 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHKA1P46020 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PHKA1P46020 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PHKA1P46020 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PHKA1P46020 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PHKA1P46020 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms