Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 ELA1YNL230C 1140 nt4.84□□□□□ -1.63
SEC28P40509 PMT4YJR143C 2289 nt4.84□□□□□ -1.64
SEC28P40509 GAS2YLR343W 1668 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC28P40509 SIF2YBR103W 1608 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC28P40509 PAL1YDR348C 1500 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC28P40509 GAS4YOL132W 1416 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC28P40509 TUB2YFL037W 1374 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC28P40509 COT1YOR316C 1320 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC28P40509 AUA1YFL010W-A 285 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC28P40509 YGR269WYGR269W 327 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC28P40509 YIL163CYIL163C 354 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC28P40509 YNL174WYNL174W 573 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC28P40509 NHP6AYPR052C 282 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC28P40509 IKS1YJL057C 2004 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC28P40509 RKM4YDR257C 1485 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC28P40509 HRR25YPL204W 1485 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC28P40509 AIR2YDL175C 1035 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC28P40509 CYC1YJR048W 330 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC28P40509 SNO1YMR095C 675 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC28P40509 TPP1YMR156C 717 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC28P40509 MDG1YNL173C 1101 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC28P40509 HSP26YBR072W 645 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC28P40509 GGA1YDR358W 1674 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC28P40509 YGR266WYGR266W 2106 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC28P40509 RGP1YDR137W 1992 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC28P40509 POL12YBL035C 2118 nt4.81□□□□□ -1.64
SEC28P40509 MDL1YLR188W 2088 nt4.81□□□□□ -1.64
SEC28P40509 NOP16YER002W 696 nt4.81□□□□□ -1.64
SEC28P40509 YER187WYER187W 426 nt4.81□□□□□ -1.64
SEC28P40509 TEF4YKL081W 1239 nt4.81□□□□□ -1.64
SEC28P40509 TRS33YOR115C 807 nt4.81□□□□□ -1.64
SEC28P40509 HFA1YMR207C 6372 nt4.81□□□□□ -1.64
SEC28P40509 SBE2YDR351W 2595 nt4.81□□□□□ -1.64
SEC28P40509 TYW1YPL207W 2433 nt4.81□□□□□ -1.64
SEC28P40509 PDR10YOR328W 4695 nt4.81□□□□□ -1.64
SEC28P40509 SER33YIL074C 1410 nt4.8□□□□□ -1.64
SEC28P40509 DSD1YGL196W 1287 nt4.8□□□□□ -1.64
SEC28P40509 YMR315WYMR315W 1050 nt4.8□□□□□ -1.64
SEC28P40509 SSO1YPL232W 873 nt4.8□□□□□ -1.64
SEC28P40509 YND1YER005W 1893 nt4.79□□□□□ -1.64
SEC28P40509 ORC6YHR118C 1308 nt4.79□□□□□ -1.64
SEC28P40509 EMP46YLR080W 1335 nt4.79□□□□□ -1.64
SEC28P40509 YDR274CYDR274C 372 nt4.79□□□□□ -1.64
SEC28P40509 RRP45YDR280W 918 nt4.79□□□□□ -1.64
SEC28P40509 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.79□□□□□ -1.64
SEC28P40509 NCE103YNL036W 666 nt4.79□□□□□ -1.64
SEC28P40509 snR17bsnR17b 332 nt4.79□□□□□ -1.64
SEC28P40509 MAK3YPR051W 531 nt4.79□□□□□ -1.64
SEC28P40509 RRP3YHR065C 1506 nt4.78□□□□□ -1.64
SEC28P40509 YDL124WYDL124W 939 nt4.78□□□□□ -1.64
SEC28P40509 ARO2YGL148W 1131 nt4.78□□□□□ -1.64
SEC28P40509 YNG2YHR090C 849 nt4.78□□□□□ -1.64
SEC28P40509 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.78□□□□□ -1.64
SEC28P40509 LDB18YLL049W 540 nt4.78□□□□□ -1.64
SEC28P40509 RFU1YLR073C 603 nt4.78□□□□□ -1.64
SEC28P40509 MAP2YBL091C 1266 nt4.78□□□□□ -1.64
SEC28P40509 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt4.78□□□□□ -1.64
SEC28P40509 TGS1YPL157W 948 nt4.78□□□□□ -1.64
SEC28P40509 KAR2YJL034W 2049 nt4.78□□□□□ -1.64
SEC28P40509 CTT1YGR088W 1689 nt4.77□□□□□ -1.65
SEC28P40509 CDC4YFL009W 2340 nt4.77□□□□□ -1.65
SEC28P40509 PFA5YDR459C 1125 nt4.77□□□□□ -1.65
SEC28P40509 TIM21YGR033C 720 nt4.77□□□□□ -1.65
SEC28P40509 YGR153WYGR153W 654 nt4.77□□□□□ -1.65
SEC28P40509 MIM2YLR099W-A 264 nt4.77□□□□□ -1.65
SEC28P40509 YPL199CYPL199C 723 nt4.77□□□□□ -1.65
SEC28P40509 YMR196WYMR196W 3267 nt4.77□□□□□ -1.65
SEC28P40509 DAS2YDR020C 699 nt4.76□□□□□ -1.65
SEC28P40509 KEX1YGL203C 2190 nt4.76□□□□□ -1.65
SEC28P40509 PHO12YHR215W 1404 nt4.76□□□□□ -1.65
SEC28P40509 YKL023WYKL023W 834 nt4.76□□□□□ -1.65
SEC28P40509 PHO11YAR071W 1404 nt4.76□□□□□ -1.65
SEC28P40509 GSP2YOR185C 663 nt4.76□□□□□ -1.65
SEC28P40509 SET6YPL165C 1122 nt4.76□□□□□ -1.65
SEC28P40509 BUD7YOR299W 2241 nt4.76□□□□□ -1.65
SEC28P40509 PUT1YLR142W 1431 nt4.75□□□□□ -1.65
SEC28P40509 MOB2YFL034C-B 864 nt4.75□□□□□ -1.65
SEC28P40509 MMS2YGL087C 414 nt4.75□□□□□ -1.65
SEC28P40509 CIA2YHR122W 696 nt4.75□□□□□ -1.65
SEC28P40509 YLL017WYLL017W 312 nt4.75□□□□□ -1.65
SEC28P40509 ELO3YLR372W 1038 nt4.75□□□□□ -1.65
SEC28P40509 SOL1YNR034W 966 nt4.75□□□□□ -1.65
SEC28P40509 MFM1YPL060W 1242 nt4.75□□□□□ -1.65
SEC28P40509 SWC3YAL011W 1878 nt4.75□□□□□ -1.65
SEC28P40509 SUL2YLR092W 2682 nt4.74□□□□□ -1.65
SEC28P40509 MCM2YBL023C 2607 nt4.74□□□□□ -1.65
SEC28P40509 SFK1YKL051W 1062 nt4.74□□□□□ -1.65
SEC28P40509 PEX22YAL055W 543 nt4.74□□□□□ -1.65
SEC28P40509 YRA2YKL214C 612 nt4.74□□□□□ -1.65
SEC28P40509 MDM34YGL219C 1380 nt4.74□□□□□ -1.65
SEC28P40509 VHC1YBR235W 3363 nt4.74□□□□□ -1.65
SEC28P40509 OAF1YAL051W 3144 nt4.74□□□□□ -1.65
SEC28P40509 CRT10YOL063C 2874 nt4.74□□□□□ -1.65
SEC28P40509 FMP30YPL103C 1407 nt4.73□□□□□ -1.65
SEC28P40509 DRN1YGR093W 1524 nt4.73□□□□□ -1.65
SEC28P40509 LPP1YDR503C 825 nt4.73□□□□□ -1.65
SEC28P40509 FRA2YGL220W 363 nt4.73□□□□□ -1.65
SEC28P40509 VPS29YHR012W 849 nt4.73□□□□□ -1.65
SEC28P40509 APS1YLR170C 471 nt4.73□□□□□ -1.65
SEC28P40509 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.73□□□□□ -1.65
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