Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN7P35236 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.6 ms