Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC5P28715 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERCC5P28715 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC5P28715 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms