Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RLBP1P12271 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RLBP1P12271 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms