Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC166P0CW27 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC166P0CW27 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms