Protein–RNA interactions for Protein: P02771

AFP, Alpha-fetoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFPP02771 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFPP02771 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFPP02771 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFPP02771 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFPP02771 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFPP02771 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFPP02771 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFPP02771 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFPP02771 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFPP02771 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFPP02771 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFPP02771 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFPP02771 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AFPP02771 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFPP02771 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFPP02771 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFPP02771 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFPP02771 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFPP02771 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFPP02771 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFPP02771 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFPP02771 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFPP02771 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFPP02771 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFPP02771 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFPP02771 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFPP02771 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFPP02771 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFPP02771 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFPP02771 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFPP02771 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFPP02771 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFPP02771 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFPP02771 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFPP02771 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFPP02771 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFPP02771 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFPP02771 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFPP02771 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFPP02771 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFPP02771 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFPP02771 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFPP02771 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFPP02771 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFPP02771 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFPP02771 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFPP02771 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFPP02771 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFPP02771 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFPP02771 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFPP02771 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFPP02771 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFPP02771 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
AFPP02771 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFPP02771 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFPP02771 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFPP02771 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFPP02771 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFPP02771 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFPP02771 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFPP02771 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFPP02771 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFPP02771 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFPP02771 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFPP02771 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFPP02771 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFPP02771 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFPP02771 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFPP02771 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFPP02771 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFPP02771 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFPP02771 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFPP02771 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFPP02771 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFPP02771 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFPP02771 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFPP02771 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFPP02771 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFPP02771 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AFPP02771 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFPP02771 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFPP02771 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFPP02771 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFPP02771 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFPP02771 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFPP02771 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFPP02771 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFPP02771 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFPP02771 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFPP02771 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFPP02771 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFPP02771 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFPP02771 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFPP02771 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AFPP02771 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFPP02771 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFPP02771 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFPP02771 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFPP02771 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFPP02771 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.4 ms