Protein–RNA interactions for Protein: P00445

SOD1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], yeast

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOD1	P00445	tK(CUU)D2	tK(CUU)D2	73 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	tK(CUU)E1	tK(CUU)E1	73 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	tK(CUU)E2	tK(CUU)E2	73 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	tK(CUU)F	tK(CUU)F	73 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	tK(CUU)G1	tK(CUU)G1	73 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	tK(CUU)G2	tK(CUU)G2	73 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	tK(CUU)G3	tK(CUU)G3	73 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	tK(CUU)I	tK(CUU)I	73 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	tK(CUU)J	tK(CUU)J	73 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	tK(CUU)K	tK(CUU)K	73 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	tK(CUU)M	tK(CUU)M	73 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	tK(CUU)P	tK(CUU)P	73 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	SAY1	YGR263C	1275 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	YKR073C	YKR073C	321 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	YAR019W-A	YAR019W-A	333 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	SEC13	YLR208W	894 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	RUF21	RUF21	707 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	ELA1	YNL230C	1140 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	YOR020W-A	YOR020W-A	273 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	IRC14	YOR135C	342 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	YDC1	YPL087W	954 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	SSO1	YPL232W	873 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	YPR169W-A	YPR169W-A	219 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	YPR170W-B	YPR170W-B	258 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	snR19	snR19	568 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	SYP1	YCR030C	2613 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	NUP116	YMR047C	3342 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	DRN1	YGR093W	1524 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	AVO1	YOL078W	3531 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	SFI1	YLL003W	2841 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	IPI3	YNL182C	1668 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	RAD30	YDR419W	1899 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	SKI8	YGL213C	1194 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	OKP1	YGR179C	1221 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	PCT1	YGR202C	1275 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	LDB18	YLL049W	540 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	RSF1	YMR030W	1131 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	DOM34	YNL001W	1161 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	SLZ1	YNL196C	897 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	PRD1	YCL057W	2139 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	OLE1	YGL055W	1533 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	BUD7	YOR299W	2241 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	PUT1	YLR142W	1431 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SOD1	P00445	SSB2	YNL209W	1842 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	HNT2	YDR305C	654 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	HSP31	YDR533C	714 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	RIP1	YEL024W	648 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YER138W-A	YER138W-A	105 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	RPL43B	YJR094W-A	279 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	APS1	YLR170C	471 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YBL107W-A	YBL107W-A	105 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YBR089W	YBR089W	600 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	VPS36	YLR417W	1701 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	PXA1	YPL147W	2613 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	STR2	YJR130C	1920 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YPL260W	YPL260W	1656 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YMR196W	YMR196W	3267 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	MOT2	YER068W	1764 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	KAR1	YNL188W	1302 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	CTT1	YGR088W	1689 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	ARO2	YGL148W	1131 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	DCD1	YHR144C	939 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YLR169W	YLR169W	354 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	NUP2	YLR335W	2163 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	SEC9	YGR009C	1956 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	SRV2	YNL138W	1581 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	RCK2	YLR248W	1833 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	KCH1	YJR054W	1494 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	APC4	YDR118W	1959 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YDR249C	YDR249C	1122 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	ARD1	YHR013C	717 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	FSH1	YHR049W	732 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	DCP1	YOL149W	696 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	GPI2	YPL076W	843 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	EAR1	YMR171C	1653 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	AFT1	YGL071W	2073 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	GRX6	YDL010W	696 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YFT2	YDR319C	825 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	ESF1	YDR365C	1887 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YDR545C-A	YDR545C-A	480 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YEL077W-A	YEL077W-A	483 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	UBC6	YER100W	753 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YER158C	YER158C	1722 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YER190C-B	YER190C-B	483 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YFL068W	YFL068W	483 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YGR011W	YGR011W	327 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YGR296C-B	YGR296C-B	483 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YHL050W-A	YHL050W-A	483 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YHR219C-A	YHR219C-A	483 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YIL177W-A	YIL177W-A	483 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YJL225W-A	YJL225W-A	483 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YJR012C	YJR012C	624 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	TVP38	YKR088C	1014 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	GRC3	YLL035W	1899 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YLL066W-A	YLL066W-A	483 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YLL067W-A	YLL067W-A	483 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YLR466C-A	YLR466C-A	483 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YLR467C-A	YLR467C-A	483 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YML133W-B	YML133W-B	483 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SOD1	P00445	YNL339W-B	YNL339W-B	483 nt		3.74	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.4 ms