Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C6orf47O95873 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
C6orf47O95873 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C6orf47O95873 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf47O95873 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf47O95873 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf47O95873 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf47O95873 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf47O95873 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf47O95873 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf47O95873 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf47O95873 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf47O95873 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf47O95873 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf47O95873 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf47O95873 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf47O95873 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf47O95873 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf47O95873 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf47O95873 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf47O95873 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf47O95873 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf47O95873 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf47O95873 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf47O95873 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf47O95873 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf47O95873 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf47O95873 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf47O95873 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf47O95873 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf47O95873 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf47O95873 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf47O95873 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf47O95873 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf47O95873 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf47O95873 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf47O95873 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf47O95873 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf47O95873 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf47O95873 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf47O95873 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf47O95873 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf47O95873 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf47O95873 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf47O95873 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf47O95873 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf47O95873 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf47O95873 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf47O95873 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf47O95873 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf47O95873 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf47O95873 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf47O95873 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf47O95873 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf47O95873 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf47O95873 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C6orf47O95873 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf47O95873 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf47O95873 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf47O95873 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf47O95873 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf47O95873 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf47O95873 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf47O95873 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf47O95873 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf47O95873 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf47O95873 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf47O95873 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf47O95873 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf47O95873 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf47O95873 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf47O95873 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf47O95873 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C6orf47O95873 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf47O95873 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms