Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITM2AO43736 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2AO43736 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms