Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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