Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TAPBPO15533 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAPBPO15533 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms