Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC27A2O14975 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.5 ms