Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCCD1A6NED2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms