Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I0

PCDHA13, Protocadherin alpha-13, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA13Q9Y5I0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA13Q9Y5I0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA13Q9Y5I0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms