Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAXBP1Q9Y5B6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms