Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COG6Q9Y2V7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COG6Q9Y2V7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COG6Q9Y2V7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COG6Q9Y2V7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG6Q9Y2V7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG6Q9Y2V7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms