Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A6Q9P2U8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms