Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS2Q9NYR9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms