Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A20Q9NP91 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A20Q9NP91 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A20Q9NP91 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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