Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD5Q99717 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD5Q99717 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD5Q99717 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD5Q99717 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD5Q99717 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD5Q99717 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMAD5Q99717 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD5Q99717 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD5Q99717 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD5Q99717 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD5Q99717 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD5Q99717 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD5Q99717 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMAD5Q99717 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD5Q99717 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD5Q99717 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD5Q99717 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD5Q99717 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD5Q99717 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD5Q99717 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD5Q99717 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD5Q99717 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD5Q99717 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD5Q99717 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD5Q99717 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD5Q99717 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD5Q99717 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD5Q99717 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD5Q99717 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD5Q99717 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD5Q99717 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD5Q99717 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD5Q99717 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD5Q99717 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD5Q99717 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD5Q99717 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD5Q99717 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD5Q99717 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD5Q99717 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD5Q99717 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD5Q99717 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD5Q99717 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms