Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF12Q96QT6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms