Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00301Q8NCQ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00301Q8NCQ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms