Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C17orf53Q8N3J3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms