Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIGD1Q6UXZ0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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