Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRAGBQ5VZM2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRAGBQ5VZM2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRAGBQ5VZM2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRAGBQ5VZM2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRAGBQ5VZM2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRAGBQ5VZM2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRAGBQ5VZM2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRAGBQ5VZM2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRAGBQ5VZM2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRAGBQ5VZM2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRAGBQ5VZM2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRAGBQ5VZM2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRAGBQ5VZM2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms