Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms