Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9L6

TMEM119, Transmembrane protein 119, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM119Q4V9L6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM119Q4V9L6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms