Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK2Q16620 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK2Q16620 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
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