Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NEDD8Q15843 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NEDD8Q15843 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8Q15843 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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