Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF1Q14990 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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