Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCARB2Q14108 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARB2Q14108 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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