Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms