Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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SCGB2A2Q13296 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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SCGB2A2Q13296 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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SCGB2A2Q13296 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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SCGB2A2Q13296 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCGB2A2Q13296 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCGB2A2Q13296 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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