Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 CDC15YAR019C 2925 nt4.07□□□□□ -1.76
USB1Q12208 TDA7YNL176C 1911 nt4.07□□□□□ -1.76
USB1Q12208 GDE1YPL110C 3672 nt4.07□□□□□ -1.76
USB1Q12208 TIF4632YGL049C 2745 nt4.07□□□□□ -1.76
USB1Q12208 GSY1YFR015C 2127 nt4.06□□□□□ -1.76
USB1Q12208 MLF3YNL074C 1359 nt4.06□□□□□ -1.76
USB1Q12208 PRO2YOR323C 1371 nt4.06□□□□□ -1.76
USB1Q12208 ARC1YGL105W 1131 nt4.06□□□□□ -1.76
USB1Q12208 NTR2YKR022C 969 nt4.06□□□□□ -1.76
USB1Q12208 REC114YMR133W 1287 nt4.06□□□□□ -1.76
USB1Q12208 ARG8YOL140W 1272 nt4.06□□□□□ -1.76
USB1Q12208 TPS3YMR261C 3165 nt4.06□□□□□ -1.76
USB1Q12208 GSM1YJL103C 1857 nt4.06□□□□□ -1.76
USB1Q12208 HIS4YCL030C 2400 nt4.05□□□□□ -1.76
USB1Q12208 SSA2YLL024C 1920 nt4.05□□□□□ -1.76
USB1Q12208 SSB1YDL229W 1842 nt4.05□□□□□ -1.76
USB1Q12208 SSB2YNL209W 1842 nt4.05□□□□□ -1.76
USB1Q12208 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt4.05□□□□□ -1.76
USB1Q12208 RPL34AYER056C-A 366 nt4.05□□□□□ -1.76
USB1Q12208 PAU17YLL025W 375 nt4.05□□□□□ -1.76
USB1Q12208 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.05□□□□□ -1.76
USB1Q12208 APS1YLR170C 471 nt4.05□□□□□ -1.76
USB1Q12208 FEX1YOR390W 1128 nt4.05□□□□□ -1.76
USB1Q12208 FEX2YPL279C 1128 nt4.05□□□□□ -1.76
USB1Q12208 OAF1YAL051W 3144 nt4.05□□□□□ -1.76
USB1Q12208 TRM44YPL030W 1704 nt4.04□□□□□ -1.76
USB1Q12208 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.04□□□□□ -1.76
USB1Q12208 MRPL39YML009C 213 nt4.04□□□□□ -1.76
USB1Q12208 IMP2YMR035W 534 nt4.04□□□□□ -1.76
USB1Q12208 AIF1YNR074C 1137 nt4.04□□□□□ -1.76
USB1Q12208 MED4YOR174W 855 nt4.04□□□□□ -1.76
USB1Q12208 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.04□□□□□ -1.76
USB1Q12208 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.04□□□□□ -1.76
USB1Q12208 AVT1YJR001W 1809 nt4.04□□□□□ -1.76
USB1Q12208 LDB17YDL146W 1476 nt4.04□□□□□ -1.76
USB1Q12208 YJL206CYJL206C 2277 nt4.04□□□□□ -1.76
USB1Q12208 RVB1YDR190C 1392 nt4.03□□□□□ -1.76
USB1Q12208 IZH3YLR023C 1632 nt4.03□□□□□ -1.76
USB1Q12208 YND1YER005W 1893 nt4.03□□□□□ -1.76
USB1Q12208 HOM3YER052C 1584 nt4.03□□□□□ -1.76
USB1Q12208 SUT1YGL162W 900 nt4.03□□□□□ -1.76
USB1Q12208 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt4.03□□□□□ -1.76
USB1Q12208 YAR061WYAR061W 204 nt4.03□□□□□ -1.76
USB1Q12208 SOL1YNR034W 966 nt4.03□□□□□ -1.76
USB1Q12208 RRB1YMR131C 1536 nt4.03□□□□□ -1.76
USB1Q12208 CRT10YOL063C 2874 nt4.03□□□□□ -1.76
USB1Q12208 SUP35YDR172W 2058 nt4.02□□□□□ -1.77
USB1Q12208 ARG4YHR018C 1392 nt4.02□□□□□ -1.77
USB1Q12208 SLD2YKL108W 1362 nt4.02□□□□□ -1.77
USB1Q12208 AXL2YIL140W 2472 nt4.02□□□□□ -1.77
USB1Q12208 KRE6YPR159W 2163 nt4.02□□□□□ -1.77
USB1Q12208 NPY1YGL067W 1155 nt4.02□□□□□ -1.77
USB1Q12208 ECM15YBL001C 315 nt4.02□□□□□ -1.77
USB1Q12208 ATG17YLR423C 1254 nt4.02□□□□□ -1.77
USB1Q12208 YPL191CYPL191C 1083 nt4.02□□□□□ -1.77
USB1Q12208 MNT2YGL257C 1677 nt4.02□□□□□ -1.77
USB1Q12208 GMC1YDR506C 1827 nt4.02□□□□□ -1.77
USB1Q12208 APC4YDR118W 1959 nt4.02□□□□□ -1.77
USB1Q12208 CDC48YDL126C 2508 nt4.01□□□□□ -1.77
USB1Q12208 YDL027CYDL027C 1263 nt4.01□□□□□ -1.77
USB1Q12208 TYW3YGL050W 822 nt4.01□□□□□ -1.77
USB1Q12208 NVJ1YHR195W 966 nt4.01□□□□□ -1.77
USB1Q12208 YPL113CYPL113C 1191 nt4.01□□□□□ -1.77
USB1Q12208 YPL245WYPL245W 1365 nt4.01□□□□□ -1.77
USB1Q12208 MPS3YJL019W 2049 nt4□□□□□ -1.77
USB1Q12208 IKS1YJL057C 2004 nt4□□□□□ -1.77
USB1Q12208 TUB3YML124C 1338 nt4□□□□□ -1.77
USB1Q12208 SWI3YJL176C 2478 nt4□□□□□ -1.77
USB1Q12208 PRM1YNL279W 1986 nt4□□□□□ -1.77
USB1Q12208 DIT1YDR403W 1611 nt4□□□□□ -1.77
USB1Q12208 SKG3YLR187W 3081 nt4□□□□□ -1.77
USB1Q12208 PRP28YDR243C 1767 nt4□□□□□ -1.77
USB1Q12208 CPR4YCR069W 957 nt4□□□□□ -1.77
USB1Q12208 HNT2YDR305C 654 nt4□□□□□ -1.77
USB1Q12208 RIP1YEL024W 648 nt4□□□□□ -1.77
USB1Q12208 DAM1YGR113W 1032 nt4□□□□□ -1.77
USB1Q12208 YHL049CYHL049C 816 nt4□□□□□ -1.77
USB1Q12208 YMR082CYMR082C 357 nt4□□□□□ -1.77
USB1Q12208 MRP21YBL090W 534 nt4□□□□□ -1.77
USB1Q12208 TAF5YBR198C 2397 nt4□□□□□ -1.77
USB1Q12208 SYP1YCR030C 2613 nt4□□□□□ -1.77
USB1Q12208 KGD1YIL125W 3045 nt4□□□□□ -1.77
USB1Q12208 RTT103YDR289C 1230 nt3.99□□□□□ -1.77
USB1Q12208 YEL045CYEL045C 426 nt3.99□□□□□ -1.77
USB1Q12208 ATG33YLR356W 594 nt3.99□□□□□ -1.77
USB1Q12208 SLZ1YNL196C 897 nt3.99□□□□□ -1.77
USB1Q12208 YIF1YNL263C 945 nt3.99□□□□□ -1.77
USB1Q12208 BUD17YNR027W 954 nt3.99□□□□□ -1.77
USB1Q12208 snR19snR19 568 nt3.99□□□□□ -1.77
USB1Q12208 PAD1YDR538W 729 nt3.98□□□□□ -1.77
USB1Q12208 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt3.98□□□□□ -1.77
USB1Q12208 DCV1YFR012W 609 nt3.98□□□□□ -1.77
USB1Q12208 YCL022CYCL022C 516 nt3.98□□□□□ -1.77
USB1Q12208 RAD28YDR030C 1521 nt3.98□□□□□ -1.77
USB1Q12208 GIP4YAL031C 2283 nt3.98□□□□□ -1.77
USB1Q12208 RIM21YNL294C 1602 nt3.98□□□□□ -1.77
USB1Q12208 SAP4YGL229C 2457 nt3.97□□□□□ -1.77
USB1Q12208 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt3.97□□□□□ -1.77
USB1Q12208 ELC1YPL046C 300 nt3.97□□□□□ -1.77
USB1Q12208 snR3snR3 194 nt3.97□□□□□ -1.77
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