Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	SAM4	YPL273W	978 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	BSC5	YNR069C	1470 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	IZH3	YLR023C	1632 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	SEN1	YLR430W	6696 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	HOM3	YER052C	1584 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	HMLALPHA1	YCL066W	528 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	MATALPHA1	YCR040W	528 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YDR545C-A	YDR545C-A	480 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YEL077W-A	YEL077W-A	483 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YER190C-B	YER190C-B	483 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YFL068W	YFL068W	483 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	MF(ALPHA)2	YGL089C	363 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	SUT1	YGL162W	900 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YGR296C-B	YGR296C-B	483 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YHL050W-A	YHL050W-A	483 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YHR219C-A	YHR219C-A	483 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YIL177W-A	YIL177W-A	483 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YJL225W-A	YJL225W-A	483 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	ISA1	YLL027W	753 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YLL066W-A	YLL066W-A	483 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YLL067W-A	YLL067W-A	483 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YLR466C-A	YLR466C-A	483 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YLR467C-A	YLR467C-A	483 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YML133W-B	YML133W-B	483 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	ADD37	YMR184W	597 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YNL339W-B	YNL339W-B	483 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YBL113W-A	YBL113W-A	483 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YOR396C-A	YOR396C-A	483 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YPL283W-B	YPL283W-B	483 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YPR204C-A	YPR204C-A	483 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	IMA3	YIL172C	1770 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	IMA4	YJL221C	1770 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YGL036W	YGL036W	2730 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	BCP1	YDR361C	852 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YGR139W	YGR139W	339 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YGR182C	YGR182C	354 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	MRPL13	YKR006C	795 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	CDC42	YLR229C	576 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	CUE5	YOR042W	1236 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	ELC1	YPL046C	300 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	YPR109W	YPR109W	885 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	AVT1	YJR001W	1809 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	PTR2	YKR093W	1806 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VIK1	Q12045	MET4	YNL103W	2019 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	YDR134C	YDR134C	411 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	FAU1	YER183C	636 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	BGL2	YGR282C	942 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	UBI4	YLL039C	1146 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	IMP2	YMR035W	534 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	YOL153C	YOL153C	1746 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	PAH1	YMR165C	2589 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	THS1	YIL078W	2205 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	XKS1	YGR194C	1803 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	SSA2	YLL024C	1920 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	TRM8	YDL201W	861 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	EAF5	YEL018W	840 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	DAM1	YGR113W	1032 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	NAT2	YGR147C	867 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	PUS6	YGR169C	1215 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	SYN8	YAL014C	768 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	MTC2	YKL098W	1074 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	ROT1	YMR200W	771 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	TOG1	YER184C	2385 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	CYM1	YDR430C	2970 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	UBP7	YIL156W	3216 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	AKL1	YBR059C	3327 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	VAC7	YNL054W	3498 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	SUP35	YDR172W	2058 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	UPS3	YDR185C	540 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	MNN10	YDR245W	1182 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	YJR012C	YJR012C	624 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	MED4	YOR174W	855 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	RAD28	YDR030C	1521 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	SKM1	YOL113W	1968 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	DCV1	YFR012W	609 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	RPL43B	YJR094W-A	279 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	YAL044W-A	YAL044W-A	333 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	YPL077C	YPL077C	723 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	RRP3	YHR065C	1506 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	MET3	YJR010W	1536 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	RRB1	YMR131C	1536 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	KCC4	YCL024W	3114 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	RHB1	YCR027C	630 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	ARP2	YDL029W	1176 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	RPN12	YFR052W	825 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	SYF2	YGR129W	648 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	MTF1	YMR228W	1026 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	SSB1	YDL229W	1842 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	SSB2	YNL209W	1842 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	HRR25	YPL204W	1485 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	PHO84	YML123C	1764 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	MHR1	YDR296W	681 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	NOP16	YER002W	696 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	HEM15	YOR176W	1182 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	STE12	YHR084W	2067 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	MNN1	YER001W	2289 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	UPC2	YDR213W	2742 nt		4.46	□□□□□ -1.69
VIK1	Q12045	TOM20	YGR082W	552 nt		4.46	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	GAT4	YIR013C	366 nt		4.46	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	YBL006W-A	YBL006W-A	150 nt		4.46	□□□□□ -1.7

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