Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERVK_113P62684 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERVK_113P62684 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERVK_113P62684 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERVK_113P62684 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERVK_113P62684 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERVK_113P62684 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERVK_113P62684 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERVK_113P62684 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERVK_113P62684 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HERVK_113P62684 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERVK_113P62684 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERVK_113P62684 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERVK_113P62684 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms