Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP1P59025 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP1P59025 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP1P59025 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP1P59025 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP1P59025 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP1P59025 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP1P59025 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP1P59025 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP1P59025 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP1P59025 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP1P59025 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP1P59025 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP1P59025 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP1P59025 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP1P59025 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP1P59025 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP1P59025 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RTP1P59025 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RTP1P59025 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RTP1P59025 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RTP1P59025 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP1P59025 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP1P59025 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP1P59025 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP1P59025 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP1P59025 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP1P59025 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP1P59025 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP1P59025 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP1P59025 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP1P59025 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP1P59025 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP1P59025 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP1P59025 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP1P59025 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP1P59025 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP1P59025 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP1P59025 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTP1P59025 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTP1P59025 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTP1P59025 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTP1P59025 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTP1P59025 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTP1P59025 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTP1P59025 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RTP1P59025 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTP1P59025 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTP1P59025 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP1P59025 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP1P59025 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP1P59025 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP1P59025 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP1P59025 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP1P59025 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP1P59025 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP1P59025 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP1P59025 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTP1P59025 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTP1P59025 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTP1P59025 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTP1P59025 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTP1P59025 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTP1P59025 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTP1P59025 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP1P59025 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP1P59025 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP1P59025 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP1P59025 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP1P59025 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP1P59025 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP1P59025 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP1P59025 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP1P59025 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP1P59025 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP1P59025 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP1P59025 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP1P59025 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP1P59025 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP1P59025 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTP1P59025 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTP1P59025 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTP1P59025 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTP1P59025 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP1P59025 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP1P59025 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP1P59025 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP1P59025 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP1P59025 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP1P59025 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP1P59025 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP1P59025 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP1P59025 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTP1P59025 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTP1P59025 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTP1P59025 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTP1P59025 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTP1P59025 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTP1P59025 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTP1P59025 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms