Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AIF1P55008 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AIF1P55008 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AIF1P55008 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AIF1P55008 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AIF1P55008 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AIF1P55008 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AIF1P55008 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AIF1P55008 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AIF1P55008 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AIF1P55008 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AIF1P55008 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AIF1P55008 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AIF1P55008 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AIF1P55008 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AIF1P55008 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AIF1P55008 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AIF1P55008 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AIF1P55008 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AIF1P55008 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AIF1P55008 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AIF1P55008 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AIF1P55008 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AIF1P55008 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AIF1P55008 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AIF1P55008 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AIF1P55008 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AIF1P55008 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AIF1P55008 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AIF1P55008 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AIF1P55008 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AIF1P55008 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AIF1P55008 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
AIF1P55008 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AIF1P55008 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AIF1P55008 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AIF1P55008 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AIF1P55008 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AIF1P55008 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AIF1P55008 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AIF1P55008 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AIF1P55008 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AIF1P55008 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AIF1P55008 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AIF1P55008 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AIF1P55008 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AIF1P55008 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AIF1P55008 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AIF1P55008 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AIF1P55008 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AIF1P55008 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AIF1P55008 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AIF1P55008 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AIF1P55008 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AIF1P55008 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AIF1P55008 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AIF1P55008 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AIF1P55008 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AIF1P55008 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AIF1P55008 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AIF1P55008 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AIF1P55008 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AIF1P55008 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AIF1P55008 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AIF1P55008 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AIF1P55008 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AIF1P55008 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AIF1P55008 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AIF1P55008 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AIF1P55008 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AIF1P55008 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AIF1P55008 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AIF1P55008 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AIF1P55008 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AIF1P55008 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AIF1P55008 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AIF1P55008 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AIF1P55008 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AIF1P55008 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AIF1P55008 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AIF1P55008 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AIF1P55008 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AIF1P55008 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AIF1P55008 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AIF1P55008 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AIF1P55008 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AIF1P55008 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AIF1P55008 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AIF1P55008 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AIF1P55008 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AIF1P55008 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AIF1P55008 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AIF1P55008 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AIF1P55008 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AIF1P55008 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AIF1P55008 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AIF1P55008 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AIF1P55008 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AIF1P55008 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AIF1P55008 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms