Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMS1P54277 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMS1P54277 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMS1P54277 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMS1P54277 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMS1P54277 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMS1P54277 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS1P54277 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS1P54277 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS1P54277 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS1P54277 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS1P54277 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS1P54277 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS1P54277 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS1P54277 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS1P54277 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS1P54277 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS1P54277 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS1P54277 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS1P54277 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS1P54277 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS1P54277 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS1P54277 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS1P54277 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS1P54277 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS1P54277 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS1P54277 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS1P54277 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS1P54277 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS1P54277 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS1P54277 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMS1P54277 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMS1P54277 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMS1P54277 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMS1P54277 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMS1P54277 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMS1P54277 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMS1P54277 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMS1P54277 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMS1P54277 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMS1P54277 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMS1P54277 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMS1P54277 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMS1P54277 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMS1P54277 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMS1P54277 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMS1P54277 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMS1P54277 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMS1P54277 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMS1P54277 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PMS1P54277 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMS1P54277 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMS1P54277 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMS1P54277 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMS1P54277 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMS1P54277 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMS1P54277 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMS1P54277 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMS1P54277 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMS1P54277 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PMS1P54277 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMS1P54277 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMS1P54277 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMS1P54277 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMS1P54277 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMS1P54277 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMS1P54277 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMS1P54277 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMS1P54277 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMS1P54277 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS1P54277 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS1P54277 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS1P54277 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS1P54277 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS1P54277 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS1P54277 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS1P54277 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS1P54277 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS1P54277 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS1P54277 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS1P54277 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS1P54277 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS1P54277 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS1P54277 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS1P54277 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS1P54277 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PMS1P54277 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PMS1P54277 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS1P54277 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS1P54277 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS1P54277 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS1P54277 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS1P54277 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS1P54277 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS1P54277 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS1P54277 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS1P54277 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS1P54277 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS1P54277 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS1P54277 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms