Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNNT3P45378 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNT3P45378 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT3P45378 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms