Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCIP41743 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCIP41743 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms