Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 YDL241WYDL241W 372 nt4.8□□□□□ -1.64
SEF1P34228 YER084WYER084W 387 nt4.8□□□□□ -1.64
SEF1P34228 MHO1YJR008W 1017 nt4.8□□□□□ -1.64
SEF1P34228 CBF1YJR060W 1056 nt4.8□□□□□ -1.64
SEF1P34228 PRP45YAL032C 1140 nt4.8□□□□□ -1.64
SEF1P34228 YLR326WYLR326W 723 nt4.8□□□□□ -1.64
SEF1P34228 RHO2YNL090W 579 nt4.8□□□□□ -1.64
SEF1P34228 AIM10YER087W 1731 nt4.8□□□□□ -1.64
SEF1P34228 MLF3YNL074C 1359 nt4.79□□□□□ -1.64
SEF1P34228 RMD5YDR255C 1266 nt4.79□□□□□ -1.64
SEF1P34228 SCW4YGR279C 1161 nt4.79□□□□□ -1.64
SEF1P34228 YIL152WYIL152W 708 nt4.79□□□□□ -1.64
SEF1P34228 BUD28YLR062C 378 nt4.79□□□□□ -1.64
SEF1P34228 MIM2YLR099W-A 264 nt4.79□□□□□ -1.64
SEF1P34228 YOL024WYOL024W 519 nt4.79□□□□□ -1.64
SEF1P34228 NAT3YPR131C 588 nt4.79□□□□□ -1.64
SEF1P34228 YHL012WYHL012W 1482 nt4.79□□□□□ -1.64
SEF1P34228 PRM2YIL037C 1971 nt4.78□□□□□ -1.64
SEF1P34228 LNP1YHR192W 837 nt4.78□□□□□ -1.64
SEF1P34228 YPR098CYPR098C 486 nt4.78□□□□□ -1.64
SEF1P34228 SEG2YKL105C 3399 nt4.78□□□□□ -1.64
SEF1P34228 HRP1YOL123W 1605 nt4.78□□□□□ -1.64
SEF1P34228 ARO9YHR137W 1542 nt4.77□□□□□ -1.65
SEF1P34228 TOS3YGL179C 1683 nt4.77□□□□□ -1.65
SEF1P34228 YER085CYER085C 522 nt4.77□□□□□ -1.65
SEF1P34228 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.77□□□□□ -1.65
SEF1P34228 CAX4YGR036C 720 nt4.77□□□□□ -1.65
SEF1P34228 YMR082CYMR082C 357 nt4.77□□□□□ -1.65
SEF1P34228 PRE7YBL041W 726 nt4.77□□□□□ -1.65
SEF1P34228 HLJ1YMR161W 675 nt4.77□□□□□ -1.65
SEF1P34228 YBL044WYBL044W 369 nt4.77□□□□□ -1.65
SEF1P34228 PXA1YPL147W 2613 nt4.77□□□□□ -1.65
SEF1P34228 ATH1YPR026W 3636 nt4.77□□□□□ -1.65
SEF1P34228 YDR444WYDR444W 2064 nt4.76□□□□□ -1.65
SEF1P34228 CDC43YGL155W 1131 nt4.76□□□□□ -1.65
SEF1P34228 YLR225CYLR225C 1224 nt4.76□□□□□ -1.65
SEF1P34228 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt4.76□□□□□ -1.65
SEF1P34228 PGA2YNL149C 390 nt4.76□□□□□ -1.65
SEF1P34228 CUS2YNL286W 858 nt4.76□□□□□ -1.65
SEF1P34228 GPM3YOL056W 912 nt4.76□□□□□ -1.65
SEF1P34228 HPF1YOL155C 2904 nt4.76□□□□□ -1.65
SEF1P34228 ADE6YGR061C 4077 nt4.76□□□□□ -1.65
SEF1P34228 YTA6YPL074W 2265 nt4.76□□□□□ -1.65
SEF1P34228 SIR1YKR101W 1965 nt4.76□□□□□ -1.65
SEF1P34228 ULA1YPL003W 1389 nt4.76□□□□□ -1.65
SEF1P34228 DAL81YIR023W 2913 nt4.76□□□□□ -1.65
SEF1P34228 PHO90YJL198W 2646 nt4.76□□□□□ -1.65
SEF1P34228 TGL1YKL140W 1647 nt4.75□□□□□ -1.65
SEF1P34228 CUS1YMR240C 1311 nt4.75□□□□□ -1.65
SEF1P34228 ASA1YPR085C 1332 nt4.75□□□□□ -1.65
SEF1P34228 CAB3YKL088W 1716 nt4.75□□□□□ -1.65
SEF1P34228 TCM62YBR044C 1719 nt4.75□□□□□ -1.65
SEF1P34228 YPK3YBR028C 1578 nt4.75□□□□□ -1.65
SEF1P34228 YAP1YML007W 1953 nt4.75□□□□□ -1.65
SEF1P34228 ERG4YGL012W 1422 nt4.75□□□□□ -1.65
SEF1P34228 GCV1YDR019C 1203 nt4.75□□□□□ -1.65
SEF1P34228 NSE3YDR288W 912 nt4.75□□□□□ -1.65
SEF1P34228 HOR7YMR251W-A 180 nt4.75□□□□□ -1.65
SEF1P34228 RPS19BYNL302C 435 nt4.75□□□□□ -1.65
SEF1P34228 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt4.75□□□□□ -1.65
SEF1P34228 GSP2YOR185C 663 nt4.75□□□□□ -1.65
SEF1P34228 CNA1YLR433C 1662 nt4.75□□□□□ -1.65
SEF1P34228 HFI1YPL254W 1467 nt4.75□□□□□ -1.65
SEF1P34228 RNY1YPL123C 1305 nt4.74□□□□□ -1.65
SEF1P34228 ABD1YBR236C 1311 nt4.74□□□□□ -1.65
SEF1P34228 HEM3YDL205C 984 nt4.74□□□□□ -1.65
SEF1P34228 COS4YFL062W 1140 nt4.74□□□□□ -1.65
SEF1P34228 SSY5YJL156C 2100 nt4.74□□□□□ -1.65
SEF1P34228 COS3YML132W 1140 nt4.74□□□□□ -1.65
SEF1P34228 ROX3YBL093C 663 nt4.74□□□□□ -1.65
SEF1P34228 COS2YBR302C 1140 nt4.74□□□□□ -1.65
SEF1P34228 TUB2YFL037W 1374 nt4.74□□□□□ -1.65
SEF1P34228 GAS5YOL030W 1455 nt4.74□□□□□ -1.65
SEF1P34228 MOT2YER068W 1764 nt4.73□□□□□ -1.65
SEF1P34228 RKM2YDR198C 1440 nt4.73□□□□□ -1.65
SEF1P34228 ALD3YMR169C 1521 nt4.73□□□□□ -1.65
SEF1P34228 ALD2YMR170C 1521 nt4.73□□□□□ -1.65
SEF1P34228 SPR28YDR218C 1272 nt4.73□□□□□ -1.65
SEF1P34228 GLO2YDR272W 825 nt4.73□□□□□ -1.65
SEF1P34228 YDR282CYDR282C 1245 nt4.73□□□□□ -1.65
SEF1P34228 CAB1YDR531W 1104 nt4.73□□□□□ -1.65
SEF1P34228 YHL045WYHL045W 348 nt4.73□□□□□ -1.65
SEF1P34228 YNG2YHR090C 849 nt4.73□□□□□ -1.65
SEF1P34228 ATP12YJL180C 978 nt4.73□□□□□ -1.65
SEF1P34228 YJR012CYJR012C 624 nt4.73□□□□□ -1.65
SEF1P34228 OMA1YKR087C 1038 nt4.73□□□□□ -1.65
SEF1P34228 MRPL15YLR312W-A 762 nt4.73□□□□□ -1.65
SEF1P34228 YBL077WYBL077W 432 nt4.73□□□□□ -1.65
SEF1P34228 HRT1YOL133W 366 nt4.73□□□□□ -1.65
SEF1P34228 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt4.73□□□□□ -1.65
SEF1P34228 FUM1YPL262W 1467 nt4.73□□□□□ -1.65
SEF1P34228 CDC4YFL009W 2340 nt4.72□□□□□ -1.65
SEF1P34228 COS7YDL248W 1152 nt4.72□□□□□ -1.65
SEF1P34228 RPN12YFR052W 825 nt4.72□□□□□ -1.65
SEF1P34228 SCL1YGL011C 759 nt4.72□□□□□ -1.65
SEF1P34228 YPT32YGL210W 669 nt4.72□□□□□ -1.65
SEF1P34228 SAY1YGR263C 1275 nt4.72□□□□□ -1.65
SEF1P34228 COS5YJR161C 1152 nt4.72□□□□□ -1.65
SEF1P34228 PDX3YBR035C 687 nt4.72□□□□□ -1.65
SEF1P34228 ATG14YBR128C 1035 nt4.72□□□□□ -1.65
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