Protein–RNA interactions for Protein: P15621

ZNF44, Zinc finger protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF44P15621 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms